Expedițiile științifice organizate de Muzeu au ca obiectiv principal explorarea unor zone mai puțin abordate din punct de vedere al biodiversității, cu scopul de a aduce contribuții noi și semnificative la cunoașterea biodiversității mondiale (în special a faunei). Printre obiectivele expedițiilor Muzeului se numără și: îmbogățirea colecțiilor MNINGA cu material biologic valoros atât din punct de vedere științific, cât și din punct de vedere expozițional; dezvoltarea relațiilor internaționale de colaborare ale Muzeului cu alte instituții de profil și cu alți specialiști din domeniu. O parte din materialul biologic adus în urma expedițiilor va sta la baza organizării unor expoziții temporare viitoare (mai întâi în spațiul expozițional al Muzeului, ulterior și în alte spații expoziționale din România) care vor avea printre altele și rolul de a descoperi publicului activitățile științifice ale specialiștilor din cadrul muzeului. De asemenea, rezultatele științifice obținute în urma cercetărilor efectuate atât în teren, cât și ulterior în laborator asupra materialului biologic prelevat, vor fi valorificate în cadrul unor lucrări științifice publicate în reviste științifice internaționale de prestigiu. Printre cele mai importante descoperiri pe care le pot face cercetătorii Muzeului în cadrul acestor expediții sau doar prin cercetarea materialului biologic colectat și adus în laboratoarele Muzeului, sunt descoperirile de specii noi pentru știință.