Colecţiile ştiinţifice de coleoptere numără laolaltă peste 243.000 de exemplare. Printre acestea se păstrează exemplare donate în 1882 şi 1895 de către dr. Hilarie Mitrea (materiale adunate în perioada 1869–1893)...
Colecţiile de Diptere sunt împărțite în: Colecţia științifică de diptere fauna României, Colecţia științifică de Syrphidae Vladimir Brădescu, Colecţia de faună mondială, Colecţia de exemplare tip și o colecție de studiu.
Colecţiile de heteroptere (ploşniţe) cuprind peste 47.000 exemplare. Între acestea se numără și Colecția științifică de heteroptere palearctice, exotice și exemplare tip organizată de către Arnold Lucien Montandon...
Colecţiile de himenoptere ale Muzeului Grigore Antipa numără în prezent 93.637 exemplare şi sunt formate în principal din material colectat din România (peste 91.000 exemplare).
Muzeul deţine cea mai mare şi mai valoroasă Colecţie de lepidoptere (fluturi şi molii) din România, cu peste 359.000 de exemplare, din cca. 20.000 de specii.
Colecţiile științifice de Orthoptere cuprind Colecţia de Orthoptere exotice şi Colecţia de Orthoptere - Fauna României. Ultima cuprinde 10.367 exemplare din toate regiunile ţării.
Muzeul deține numeroase colecții din rândul ordinelor mai puțin cunoscute ale clasei Insecta. Între acestea se numără o importantă colecție de trichoptere...